Новый рекордустановлен суперкомпьютером Anton, спроектированным в исследовательском центре Дэвидом Шоу (David Shaw). Компьютер установил рекорд в моделировании процессов динамических изменений белков, происходящие в течение одной миллисекунды. Это огромный, по меркам молекулярной динамики, промежуток времени. Изменения первоначальной полипептидной цепи протеина, приводят к созданию трехмерной структуры, которая и определяет его функции. Процесс изменения до сих пор плохо изучен, и лишь известная последовательность аминокислот позволяла просчитывать ученым итоговое строение протеина.

Разобраться с динамикой трехмерных изменений белков, дали возможность суперкомпьютеры. Они моделируют промежуток времени, разбивая его на короткие отрезки (около 1 фемтосекунды), и программа рассчитывает каждое смещение атомов в протеине, при этом суперкомпьютер учитывает и взаимное воздействие атомов друг на друга, и их взаимовоздействия с молекулами воды. Задача поручилась суперкомпьютеру для проверки его возможностей и тестирования программного обеспечения. Для опыта выбрали белок BPTI и домен белка, называемый WW. Около трех месяцев, раньше приходилось, моделировалось процесс, протекающий за 10 микросекунд, а машина рассчитала все изменения за одну миллисекунду.

Суперкомпьютер был создан центром Дэвида Шоу, ученого занимающего 123 место из 400, самых богатых людей мира (по версии Forbes). При такой скорости прогресса, скоро станет возможным и полное моделирование всего процесса изменений крупных белков.

Важность таких достижений сложно недооценить. Создание новых лекарств и методик лечения возможно только при полной осведомленностью ученых о клеточных и молекулярных процессах. А пока, даже лечение геморроя доставляет определенную трудность врачам. Так что, будьте здоровы! Не болейте)